明朝末年，山河破碎，清军铁骑南下。公主朱婉清与贴身侍卫李承志在护送传国玉玺途中遭清军精锐伏击，二人浴血突围，一路向北，最终躲入嵩山少林寺。寺中住持妙空大师慈悲为怀，力排众议收留二人，并指派武僧慧远、慧明暗中保护。然而清军将领多铎早已探得消息，率重兵围困少林，逼迫交出公主与玉玺。少林武僧以“佛门清净，不涉俗世”为由婉拒，多铎遂以火烧古刹相要挟。危急关头，慧远破例施展少林绝学“金刚伏魔阵”，与清军精锐展开殊死搏斗。李承志虽身负重伤，仍以血肉之躯护住公主，誓言“臣在，公主在”。夜晚，多铎派刺客潜入寺中，欲暗杀公主。慧明识破诡计，与刺客在藏经阁中激战，最终以“罗汉拳”击退来敌。但寺中长老为保全寺安危，决议将公主秘密送出。李承志与慧远夜行山路，却遭清军埋伏。慧远以一敌百，李承志则在乱军中为公主挡下致命一箭，含笑而逝。公主含泪将玉玺交予慧远，嘱其转交南明义军。慧远望着晨光中远去的公主背影，默念“少林不出山，山却系苍生”。古刹钟声悠扬，仿佛在诉说着那一场忠魂与武魄的悲歌。