1926年的纽约，魔法世界正面临前所未有的危机。麻鸡（非魔法人士）对巫师的敌意日益高涨，以玛丽露为首的反魔法组织频繁活动，试图揭露并消灭一切魔法踪迹。就在此时，魔法动物学家纽特·斯卡曼德带着一只装满珍奇异兽的皮箱来到纽约，计划研究并保护这些濒危魔法生物。然而，一次意外的箱子交换，让纽特的皮箱落入了梦想开面包店的麻鸡雅各布手中。神奇动物们纷纷逃出，在纽约街头引发一连串混乱。纽特与雅各布不得不联手追捕这些调皮又危险的生物，途中结识了前傲罗蒂娜及其妹妹奎妮。随着追捕的深入，他们发现一个更大的阴谋正在酝酿——一股神秘黑暗力量威胁着整个魔法世界与麻鸡世界。纽特必须在保护神奇动物的同时，揭开真相，阻止一场可能引发全面战争的灾难。影片以丰富的想象力打造了一个充满奇幻生物与人性温情的魔法世界，探讨了尊重差异、守护信念与爱的主题。